Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI3P10071 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GLI3P10071 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI3P10071 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms