Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN25C9JDP6 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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