Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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