Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
DKK2Q9UBU2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms