Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms