Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B0

UNK, RING finger protein unkempt homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UNKQ9C0B0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.05■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UNKQ9C0B0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UNKQ9C0B0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms