Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 KIAA0513-206ENST00000566428 7772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TBC1D27-201ENST00000261651 4838 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CACNA1E-205ENST00000367570 9724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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