Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf50Q6ZRC1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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