Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms