Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EEA1Q15075 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEA1Q15075 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms