Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms