Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms