Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREMQ03060 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms