Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms