Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPINC1P01008 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPINC1P01008 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms