Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD6O43541 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms