Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms