Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPOPA6NHQ4 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.2 ms