Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERAC1Q96JX3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms