Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL24A1Q17RW2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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