Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SGCBQ16585 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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