Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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SS18Q15532 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SS18Q15532 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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SS18Q15532 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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SS18Q15532 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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SS18Q15532 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SS18Q15532 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SS18Q15532 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SS18Q15532 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SS18Q15532 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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