Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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