Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRIM25Q14258 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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