Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCGB2A2Q13296 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCGB2A2Q13296 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCGB2A2Q13296 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCGB2A2Q13296 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCGB2A2Q13296 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCGB2A2Q13296 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCGB2A2Q13296 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCGB2A2Q13296 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCGB2A2Q13296 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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SCGB2A2Q13296 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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SCGB2A2Q13296 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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SCGB2A2Q13296 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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