Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP1B1Q10567 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms