Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLTCQ00610 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLTCQ00610 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms