Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZBED6P86452 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms