Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNJ1P48048 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms