Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT1P21579 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT1P21579 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT1P21579 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYT1P21579 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYT1P21579 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms