Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF839A8K0R7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms