Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SH3BP4Q9P0V3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SH3BP4Q9P0V3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SH3BP4Q9P0V3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SH3BP4Q9P0V3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SH3BP4Q9P0V3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SH3BP4Q9P0V3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SH3BP4Q9P0V3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SH3BP4Q9P0V3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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