Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms