Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms