Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGF29Q96ES7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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