Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDCCAG3Q96C92 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SDCCAG3Q96C92 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SDCCAG3Q96C92 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SDCCAG3Q96C92 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SDCCAG3Q96C92 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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