Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TTC16Q8NEE8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TTC16Q8NEE8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TTC16Q8NEE8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TTC16Q8NEE8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TTC16Q8NEE8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TTC16Q8NEE8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTC16Q8NEE8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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