Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RASGEF1CQ8N431 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RASGEF1CQ8N431 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RASGEF1CQ8N431 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RASGEF1CQ8N431 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RASGEF1CQ8N431 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RASGEF1CQ8N431 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RASGEF1CQ8N431 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RASGEF1CQ8N431 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RASGEF1CQ8N431 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RASGEF1CQ8N431 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RASGEF1CQ8N431 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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RASGEF1CQ8N431 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1CQ8N431 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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