Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC38Q502W7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms