Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF2Q15853 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
USF2Q15853 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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