Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NHLH2Q02577 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NHLH2Q02577 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms