Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNAP25P60880 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNAP25P60880 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms