Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms