Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MLH1P40692 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MLH1P40692 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MLH1P40692 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms