Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA10P31260 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms