Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PLNP26678 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms