Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ME2P23368 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ME2P23368 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms