Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXQ1Q9C009 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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FOXQ1Q9C009 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXQ1Q9C009 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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FOXQ1Q9C009 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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