Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCD2Q9BXW9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms