Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGAP3Q96P47 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms